Occupant la plus ancienne partie du Fort Royal de l'île Sainte-Marguerite, le Musée de la Mer est un musée d'archéologie sous-marine et terrestre.
Le musée s'articule autour de l'ancienne prison avec la cellule de l'homme au masque de fer, les citernes romaines du vieux château et, au premier étage, sa collection d'objets provenant des épaves romaines et sarrasines ainsi que des fresques romaines. Le musée présente aussi des maquettes explicatives et des oeuvres d'art contemporaines. Ses expositions temporaires ont lieu en été sur la vaste terrasse dominant la mer.